Knihovny napsané v Nextflow u
rnaseq
Potrubí pro analýzu sekvenování RNA pomocí STAR, RSEM, HISAT2 nebo Salmon s počty genů/izoforem a rozsáhlou kontrolou kvality.
- 646
- MIT
sarek
Analytický kanál pro detekci zárodečných nebo somatických variant (předzpracování, volání variant a anotace) z WGS / cílené sekvenování.
- 256
- MIT
configs
Konfigurační soubory používané k definování parametrů specifických pro výpočetní prostředí v různých institucích (podle nf-core).
- 71
- MIT